上海第二医科大学法语培训中心于1987年由国家卫生部下文件成立。建立初期以培养援助法语国家医疗队医生以及赴法语国家进修医生为主,后者主要是世界卫生组织奖学金/笹川奖学金派出人员。目前,中心培养的学员包括各个不同领域,教授内容也不局限于医学,包括基础法语和科技法语。
上海第二医科大学开设医学法语班,学生必须参加高考,2003年该班录取的高考分在520分以上。二医大医学法语班的法语教学由中心教师承担。
九十年代初,二医大法语培训中心与法国罗-阿大区及格勒诺布尔第三大学等签订了合作协议。该协议由当时上海市市长朱鎔基亲自签字,经国家教委批准。根据协议,法方每年派两名法语教师来中心任教。
此后中心逐步对外开放,为全社会服务。十六年来,中心举办的班次有夜校一百二十七个班级,全日制、半日制二十八个班级,学员结业人数达3817人次。